VILNIUS, gruodžio 29 — Sputnik. Aukštosios ekonomikos mokyklos mokslininkai kartu su kolegomis iš kitų Rusijos institucijų sudarė pigaus ir greito COVID-19 testo kūrimo strategiją. Aprašymas paskelbtas žurnale "Applied Biochemistry and Microbiology".
Yra keletas sistemų, kurios nustato SARS-CoV-2 pėdsakus kraujo mėginiuose arba žmogaus sekretuose, variantų. Paprastai jie aptinka viruso RNR fragmentus, naudodami polimerazės grandininę reakciją (PGR) ir jos analogus, arba COVID-19 antikūnus. Paprastai tokiems tyrimams reikia daug laiko – nuo 30 minučių iki kelių valandų, be to, atliekami jie specialiose laboratorijose, kurios yra ne kiekvienoje vietovėje. Todėl mokslininkai ieško naujų, greitesnių koronaviruso ar jo antikūnų nustatymo metodų.
Autorių siūloma technika pagrįsta kilpinės izoterminės amplifikacijos (LAMP) technologija, kuri leidžia iš biologinių mėginių dauginti tam tikrus viruso DNR ar RNR fragmentus, naudojant specialius karštuosiuose šaltiniuose gyvenančių ekstremofilinių bakterijų žymenis ir fermentus.
Pagrindinis šio metodo pranašumas, palyginti su PGR testais, — galimybė atlikti visus tyrimo etapus toje pačioje temperatūroje. Be to, be išankstinio apdorojimo laboratorijoje, gleivių ir kraujo mėginiai gali būti iškart ištirti, ar nėra SARS-CoV-2 pėdsakų.
Pirmosios straipsnio autorės, Aukštosios ekonomikos mokyklos Biologijos ir biotechnologijų fakulteto docentės Julijos Makarovos teigimu, tai žymiai sumažins COVID-19 testų kainą ir pagreitins procesą, nes tam nereikia nei specialiai apmokytų specialistų, nei brangios įrangos.
"Virusas mutuoja gana greitai, o prieš metus sukurtos testavimo sistemos gali būti ne tokios efektyvios kaip anksčiau. Mes analizuojame mutacijas ir ieškome stabiliausių viruso genomo plotų. Tai padės sukurti testų sistemas, kurios atpažintų visus esamus variantus ir, svarbiausia, naujas, kurios atsiras", – sakė Makarova.
Norėdami išspręsti šią problemą, biologai ieško SARS-CoV-2 genomo dalių, kurios laikui bėgant beveik nesikeičia. Jos taps žymenimis, kuriuos bakterijų fermentai naudos viruso RNR paversti DNR ir tolesniam jos dauginimuisi.
Autoriai tikisi, kad kartu su jau esamais LAMP komponentais tai leis sukurti universalią COVID-19 testų sistemą, kuri gali greitai aptikti bet kokių koronaviruso mutacijų pėdsakus.